学术期刊论文的13个补充材料示例

学术期刊论文的13个补充材料示例（及其优质制作方法）

补充材料已成为现代学术出版的核心组成部分。数字平台使期刊能够托管丰富多样的资料——数据集、代码、视频、扩展方法——这些内容无法容纳于有限页数的文章中。合理使用时，补充材料提升透明度、可重复性和读者参与度。使用不当则成了混乱的堆积，令审稿人困惑并危及长期可访问性。本指南阐明何为有效补充材料，如何为目标期刊打包，并提供13个具体示例供您参考——包括命名、格式和合规提示，帮助避免常见陷阱。

基本原则：期刊通常对“补充材料”的含义

跨学科来看，期刊普遍将补充材料视为直接相关、明确链接的资源，支持（但非严格要求理解）主文。它们增加深度、验证和重用价值，同时不至于淹没叙述。术语多样——补充材料、支持信息、在线附录、辅助文件——政策在允许内容、审查方式和接受格式上各有不同。

始终从作者指南开始。注意：

• 范围：接受哪些类型？对新分析或额外论证有何限制？
• 文件类型与限制：首选格式（CSV、TXT、PDF、MP4）、最大尺寸、单文件与多文件政策。
• 审稿与校对：补充材料会经过同行评审还是以“作者提供原样”发布？
• 索引与托管：补充材料是托管在出版商网站、存储库，还是两者兼有？
• 许可与数据共享：所需许可（例如，CC BY）和存储库要求。

13个补充材料示例（含包装技巧）

1. 扩展方法（详细协议与材料）

   保持主论文的 方法 简洁；将逐步协议、试剂清单、仪器设置、预注册链接和偏差说明移至补充材料。

   打包：分页 PDF （补充方法），章节标题与文章对应。从正文交叉引用（例如，“见补充方法 §2.3”）。包含版本号和日期。

2. 原始数据、数据集和数据库

   提供机器可读、整洁的数据（CSV/TSV、Parquet），附带 数据字典 和 README，描述变量、单位、缺失数据代码及处理步骤。

   打包：如果数据量大，存储在可信仓库（例如机构或领域专用）并在补充材料中提供 DOI。小型数据集则上传为 CSV 及 PDF 数据指南。

3. 支持数据表

   详细的数值输出、稳健性和敏感性检查、子组分析及额外描述性统计数据放在这里。

   打包：使用与主表不同的编号方案（表 S1、S2 …）。提供简明标题和包含单位及缩写的自包含脚注。

4. 附加图表、图形和高分辨率图像

   溢出可视化、大型地图、显微镜图像和补充主线故事的替代模型图。

   打包：编号为图 S1、S2 … 包含重述关键背景的图例（使图表在分离时可解释）。如果期刊支持，提供可访问的替代文本。

5. 视频 & 动画（程序、现象、重建）

   展示难以通过静态图像传达的技术、行为反应、时间变化或模型动态。

   打包：MP4（H.264）被广泛支持。添加字幕、帧率、分辨率和 PDF 索引中的一段描述。如果音频对解释重要，提供转录文本。

6. 音频文件（语言学、实地录音、信号）

   方言示例、访谈（适当匿名处理）、生物声学信号或数据的声化。

   打包：如果文件大小允许，使用无损格式（WAV/FLAC）；否则，使用高比特率 MP3。提供元数据：说话人 ID（化名）、地点、日期、设备、采样率、同意状态。

7. 软件、代码和计算笔记本

   分析脚本、模拟代码和重现图表及结果的笔记本。对透明度和重用至关重要。

   打包：存储到带有标签版本和 DOI 的代码仓库（例如，Zenodo + GitHub）。包括 README.md、environment.yml/requirements.txt 和最小测试数据。在论文中引用提交哈希。

8. 案例研究与扩展示例

   丰富的定性小插曲、现场描述或扩展示例，这些内容会使讨论部分显得拥挤。

   打包：结构清晰的 PDF，按案例分小标题。匿名处理敏感信息并说明匿名协议。

9. 工具：问卷、调查表、表格

   提供参与者看到的确切材料（布局、顺序、分支），以及评分规则和验证参考。

   打包：高质量的 PDF 影印件和机器可读版本（CSV/JSON）的问题文本及回答选项。使用专有量表时包含许可条款。

10. 原文文本与翻译

    原文段落、用于分析的翻译、对齐表和翻译注释。

    打包：PDF 中并排列出以便阅读；分开的 UTF-8 文本文件用于计算。说明翻译方法（直译、动态对等）并在需要时证明许可。

11. 扩展的背景与情境材料

    额外的理论框架、推导、证明、工具验证或文献矩阵，这些内容有助于理解但不必使主体叙述显得杂乱。

    打包：带标签的补充说明 PDF（说明 S1、S2 …），并在文章中交叉引用。避免引入未经同行评审的新的未经验证的论断。

12. 传统附录（地图、草图、图表）

    历史上属于附录部分的材料：扩展地图、现场照片、编码方案、决策树。

    打包：整合到附录 S1，附带目录和与正文不同的图表编号。

13. 全面的“补充文件清单”

    许多期刊要求提供清单。即使不要求，也有助于审稿人和读者快速了解包内容。

    打包：一页的 PDF 索引（以及封面信中的相应部分），列出每个文件及其 1-2 句描述、格式、大小，以及（如适用）外部 DOI 或 URL。

文件命名、编号和交叉引用

清晰体现在您的文件名和标签中。使用一个稳定的命名规则，反映您在论文中引用的顺序：

• 文件名： PaperID_Supp_TableS1_MainOutcomes.csv, PaperID_Supp_FigureS3_ModelChecks.png, PaperID_Supp_Methods.pdf
• 编号：“S”前缀保留给补充材料（表S1，图S1，注释S1）。不要重复使用正文编号。
• 文中提示：“稳健性结果见表S4”，“备选先验见图S7。”

格式与无障碍：选择持久方案

• 尽可能开放、非专有：CSV/TSV、TXT/JSON/XML、PDF/A、PNG/TIFF、MP4（H.264）。避免将重要数据仅锁定在PDF中。
• 合理大小：合理压缩；拆分超大文件；对于>100–500 MB的资源使用仓库。
• 无障碍：为图形提供替代文本（如果支持），为音视频提供字幕和文字记录，使用易读字体大小和高对比度配色方案。
• 文档：每个非琐碎文件应有配套的README，说明内容、结构和来源。

伦理、同意与法律考量

• 人类数据：严格去标识；遵守数据共享的同意条款；说明任何访问控制（例如，受控访问仓库）。
• 第三方内容：为受版权保护的图片、仪器或文本获取许可；记录许可信息。
• 归属与许可：优先使用清晰、机器可读的许可（例如，文档使用CC BY，代码使用OSI批准的许可）。除非强制要求，避免“保留所有权利”。

仓库、DOI 与 FAIR 原则

许多资助机构和期刊期望数据和代码符合FAIR原则：可查找、可访问、可互操作、可重用。仓库发布持久标识符（DOI）并提升发现能力。

• 学科特定仓库：使用领域标准档案以获得更好的可见性和元数据丰富度。
• 机构或通用型：当没有社区仓库时，使用支持DOI的机构档案或通用平台。
• 链接：在主论文中引用仓库DOI，并在补充材料清单中再次列出。匹配版本（例如，“v1.1，提交 9f3e2ab”）。

质量控制：简短的提交前检查清单

• [ ] 所有补充项目均直接与文章论点相关且文中有明确引用。
• [ ] 文件使用稳定且描述性的名称；编号遵循 S 系列；包含清单。
• [ ] 格式尽可能开放；文件可在多系统打开；大小合理。
• [ ] 数据已去标识；尊重同意和许可；权限有记录。
• [ ] 代码可在干净环境中运行并附有说明；提供示例数据或存根。
• [ ] 图表是自包含的（标题、单位、图例、缩写均有定义）。
• [ ] 顶层有 README 说明文件夹结构及补充材料与论文的对应关系。

示例清单（可重复使用的模板）

Supplementary Materials – Manuscript: “Title of Paper”

S1  Supplementary Methods (PDF, 14 页)
    详细协议；试剂清单；仪器设置。

S2  Table S1 – Descriptive Statistics (CSV, 38 KB)
    变量字典见 S9。

S3  Figure S1 – Model Diagnostics (PNG, 2.1 MB)
    后验预测检查；先验见注释 S1。

S4  Data – Cleaned Dataset v1.2 (DOI: 10.xxxx/xxxx)
    托管于仓库；变量描述见 S9。

S5  Code – Analysis Release v1.2 (DOI: 10.xxxx/xxxx)
    可复现的流程；在 Python 3.11 上测试；包含环境文件。

S6  视频S1——流程演示（MP4，90秒，1080p）
    带字幕；转录本见S8。

S7  工具——调查表（PDF，6页）+ JSON模式
    跳转逻辑已记录。

S8  转录本/音频元数据（PDF，3页）
    匿名化协议；同意声明。

S9  数据字典与README（PDF，7页）
    代码手册；单位；缺失数据处理。

明智的克制：不应包含的内容

• 实质改变结论的新未审查分析。
• 主文图表的冗余副本，除非分辨率要求不同。
• 无开放替代或查看器的专有格式。
• 未经明确同意和保障的可识别个人数据。

投稿信与正文指引

帮助编辑和审稿人浏览您的材料：

• 投稿信：包含简明段落，列出补充材料、包含原因及任何仓库DOI。
• 正文中：在相关点提及关键补充材料（例如，“敏感性结果见表S4”）。避免将所有引用堆积在一段中。

最后思考：补充材料作为学术基础设施

将补充材料视为支撑您文章论点的脚手架——数据让他人验证发现，方法使复制成为可能，实物加深理解，代码将结果转化为可持续使用的资源。选择持久的格式，考虑下一位研究者进行文档编制，并与您的期刊期望精准对齐。做好了，您的补充材料不会是“额外”的；它们将成为严谨、透明学术的基础。

需要有人帮您检查补充材料包——文件格式、命名、可读性或仓库准备情况？我们的学术编辑可以在您提交前审查其清晰度、合规性和连贯性。