學術期刊論文的13個補充材料範例

學術期刊論文的 13 個補充材料範例（及如何做好）

補充材料已成為現代學術出版的核心組成。數位平台讓期刊能託管豐富多元的資料—資料集、程式碼、影片、擴展方法—這些內容無法容納於有限頁數的文章中。妥善使用時，補充材料提升透明度、可重現性與讀者參與度。使用不當則成為混亂的垃圾場，令審稿人困惑且危及長期可取得性。本指南釐清何謂有效補充材料，如何為目標期刊包裝，並提供13 個具體範例供您調整，連同命名、格式與合規建議，避免常見陷阱。

基本原則：期刊通常對「補充」的定義

跨學科而言，期刊普遍將補充材料視為直接相關、明確連結的資源，用以支持（但非理解）主文。它們增加深度、驗證與重用價值，且不會淹沒敘述。術語多樣—補充材料、支持資訊、線上附錄、輔助檔案—政策則因允許內容、審查方式及接受格式而異。

務必從作者指南開始。 注意：

• 範圍： 接受哪些類型？對新分析或額外論證有無限制？
• 檔案類型與限制： 偏好格式（CSV、TXT、PDF、MP4）、最大容量、單一檔案與多檔案政策。
• 審查與校對： 補充材料會經過同行評審，還是以「作者提供原件」方式發布？
• 索引與託管： 補充材料是託管於出版商網站、資料庫，還是兩者皆有？
• 授權與資料共享： 必要的授權（例如 CC BY）及資料庫規定。

13 個補充材料範例（含包裝技巧）

1. 擴展方法（詳細協議與材料）

   保持主文的 方法 簡潔；逐步流程、試劑清單、儀器設定、預註冊連結及偏差說明移至補充材料。

   打包：分頁 PDF （補充方法），章節標題與文章對應。主文中交叉引用（例如「見補充方法 §2.3」）。包含版本號與日期。

2. 原始資料、資料集與資料庫

   提供機器可讀、整潔的資料（CSV/TSV、Parquet）及附帶的 資料字典 和 README，說明變數、單位、缺失資料代碼及處理步驟。

   打包：若資料量大，存入可信賴的資料庫（例如機構或領域專用）並於補充材料中提供 DOI。小型資料集則上傳 CSV 及 PDF Data Guide。

3. 支援資料表

   詳細數值輸出、穩健性與敏感性檢查、子群分析及額外描述性統計資料放此處。

   打包：使用與主表不同的編號方案（表 S1、S2 …）。提供簡潔標題及包含單位和縮寫的自足式註腳。

4. 附加圖表、圖形與高解析度影像

   溢出視覺化、大型地圖、顯微影像及補充主敘事的替代模型圖。

   打包：編號為圖 S1、S2 … 包含重述關鍵背景的圖例（使圖表獨立可解讀）。若期刊支援，提供可存取的替代文字。

5. 影片與動畫（程序、現象、重建）

   展示難以用靜態圖像表達的技術、行為反應、時間變化或模型動態。

   打包：MP4（H.264）廣泛支援。添加字幕、幀率、解析度及 PDF 索引中的一段描述。若音訊對解釋重要，請提供文字稿。

6. 音訊檔案（語言學、田野錄音、信號）

   方言範例、訪談（適當匿名化）、生物聲學信號或資料的聲音化。

   打包：如果檔案大小允許，使用無損格式（WAV/FLAC）；否則使用高比特率 MP3。提供元資料：說話者 ID（化名）、地點、日期、設備、取樣率、同意狀態。

7. 軟體、代碼與計算筆記本

   分析腳本、模擬代碼和重現圖表與結果的筆記本。對透明度和重用至關重要。

   打包：存入帶有標記版本和 DOI 的代碼庫（例如 Zenodo + GitHub）。包含 README.md、environment.yml/requirements.txt 及最小測試數據。在論文中引用提交哈希。

8. 案例研究與延伸範例

   豐富的質性小品、現場描述或延伸範例，避免擁擠討論部分。

   打包：結構清晰的 PDF，依案例設子標題。匿名化敏感細節並說明匿名化程序。

9. 工具：問卷、調查、表格

   提供參與者所見的精確材料（版面、排序、分支），以及計分規則和驗證參考。

   打包：高品質 PDF 影印本及機器可讀版本（CSV/JSON）包含問題文本與回答選項。若使用專有量表，請附上授權條款。

10. 原始文本與翻譯

    原文段落、用於分析的翻譯、對齊表與翻譯註記。

    打包：PDF 中並排欄以提升可讀性；另備 UTF-8 純文字檔供計算使用。說明翻譯方法（直譯、動態對等）並在需要時證明授權。

11. 擴展背景與情境材料

    額外的理論框架、推導、證明、工具驗證或文獻矩陣，這些有助於理解但不必使主敘述繁雜。

    打包：標示清楚的 補充說明 PDF（說明 S1、S2 …），並從文章中交叉引用。避免引入未經主文審核的新主張。

12. 傳統附錄（地圖、草圖、圖表）

    歷來置於附錄的材料：擴展地圖、現場照片、編碼方案、決策樹。

    打包：整合成 附錄 S1，附有目錄和與正文不同的圖表編號。

13. 完整的「補充檔案清單」

    許多期刊要求提供清單。即使不要求，也有助於審稿人和讀者快速了解整個包裹內容。

    打包：一頁的 PDF 索引（以及封面信中相應的章節），列出每個檔案，附上 1–2 句描述、格式、大小，以及（如適用）外部 DOI 或 URL。

檔案命名、編號與交叉引用

清晰體現在您的檔名和標籤中。使用一個穩定的命名規則，與您在論文中引用的順序相呼應：

• 檔名： PaperID_Supp_TableS1_MainOutcomes.csv, PaperID_Supp_FigureS3_ModelChecks.png, PaperID_Supp_Methods.pdf
• 編號：補充資料保留“S”前綴（Table S1、Figure S1、Note S1）。主文編號不可重複使用。
• 文中提示：“穩健性結果見 Table S4，” “另見 Figure S7 以了解替代先驗。”

格式與無障礙：選擇持久方案

• 盡可能開放、非專有：CSV/TSV、TXT/JSON/XML、PDF/A、PNG/TIFF、MP4（H.264）。避免將重要資料僅鎖定於 PDF。
• 合理大小：適當壓縮；分割大型檔案；超過 100–500 MB 的資產使用資料庫。
• 無障礙：為圖表提供替代文字（若支援）、影音提供字幕與文字稿、使用易讀字型大小及高對比色彩方案。
• 文件說明：每個非瑣碎檔案應有附屬 README，說明內容、結構與來源。

倫理、同意與法律考量

• 人類資料：嚴格去識別；遵守同意條款分享資料；說明任何存取控制（例如，受控存取資料庫）。
• 第三方內容：取得受版權保護的圖片、儀器或文本的授權；記錄授權情況。
• 歸屬與授權：優先使用清晰、機器可讀的授權（例如，文件用 CC BY，程式碼用 OSI 認可授權）。除非強制，避免使用“保留所有權利”。

資料庫、DOI 與 FAIR 原則

許多資助者和期刊期望資料和程式碼符合 FAIR 原則：可尋找、可取得、可互通、可重用。資料庫會發行持久識別碼（DOI）並改善發現性。

• 學科專用資料庫：使用領域標準檔案以提升能見度和豐富的元資料。
• 機構或通用型：當沒有社群資料庫時，使用支援 DOI 的機構檔案或通用平台。
• 連結：在主文中引用資料庫 DOI，並在補充清單中再次列出。版本需匹配（例如，“v1.1, commit 9f3e2ab”）。

品質管制：投稿前簡短檢查清單

• [ ] 所有補充項目直接與文章主張相關，且文中有明確引用。
• [ ] 檔案使用穩定且具描述性的名稱；編號遵循 S 系列；包含清單。
• [ ] 格式盡可能開放；檔案可於多系統開啟；大小合理。
• [ ] 資料已去識別化；尊重同意與授權；有文件記錄權限。
• [ ] 程式碼可在乾淨環境中執行並附有說明；提供範例資料或替代檔。
• [ ] 圖表是自包含的（標題、單位、圖例、縮寫均有定義）。
• [ ] 頂層的 README 解釋資料夾結構及補充資料與論文的對應關係。

範例清單（可重用的範本）

Supplementary Materials – Manuscript: “Title of Paper”

S1  Supplementary Methods (PDF, 14 pp)
    詳細實驗流程；試劑清單；儀器設定。

S2  Table S1 – Descriptive Statistics (CSV, 38 KB)
    變數字典見 S9。

S3  Figure S1 – Model Diagnostics (PNG, 2.1 MB)
    後驗預測檢查；先驗資訊見附註 S1。

S4  Data – Cleaned Dataset v1.2 (DOI: 10.xxxx/xxxx)
    託管於儲存庫；變數說明請見 S9。

S5  Code – Analysis Release v1.2 (DOI: 10.xxxx/xxxx)
    可重現的流程；在 Python 3.11 上測試；包含環境檔案。

S6  影片 S1 – 程序示範 (MP4, 90 秒, 1080p)
    有標題；逐字稿見 S8。

S7  工具 – 調查表格 (PDF, 6 頁) + JSON 架構
    跳躍邏輯已記錄。

S8  逐字稿/音訊元資料 (PDF, 3 頁)
    匿名化協議；同意聲明。

S9  資料字典與說明文件 (PDF, 7 頁)
    程式碼手冊；單位；缺失資料處理。

明智節制：不該包含的內容

• 會實質改變結論的新、未審核分析。
• 主文圖表的重複副本，除非解析度要求不同。
• 無開放替代方案或檢視器的專有格式。
• 未經明確同意及保障措施的可識別人類資料。

投稿信與文中指示

幫助編輯和審稿人瀏覽您的資料：

• 投稿信：包含一段簡潔文字，列出補充資料、包含原因及任何資料庫 DOI。
• 文中：在相關處提及關鍵補充資料（例如，“敏感性結果見表 S4”）。避免將所有引用埋在同一段落中。

最後思考：補充資料作為學術基礎設施

將補充材料視為支撐您文章主張的腳手架——數據讓他人能驗證發現，方法使複製成為可能，實物加深理解，程式碼將結果轉化為活生生且可重用的資源。選擇持久的格式，並以下一位研究者為對象進行文件記錄，且精確符合您期刊的期望。做好了，您的補充資料不會是“額外”的；它們將是嚴謹、透明學術的基礎。

需要第二雙眼睛幫您檢查補充資料包——檔案格式、命名、可讀性或資料庫準備狀況？我們的學術編輯可以在您提交前，審核其清晰度、合規性和連貫性。